Tom ve Jerry, birbirlerini ilk gördükleri andan itibaren düşmanlık besleyen iki karakterdir ve sürekli çatışma içindedirler. Ancak bir gün karşılarına çıkan bir ejderha, bu ikilinin beklenmedik bir durumla karşılaşmasına neden oluyor. Ejderhanın yardıma ihtiyacı vardır ve bu durum, Tom ve Jerry'nin kısa süreli bir işbirliği yapmasına yol açıyor. Tom ve Jerry: Kayıp Ejderha'da, ikili düşmanlıklarını bir kenara bırakıp ejderhaya yardım etmek için bir araya geliyorlar. Fakat bu geçici uzlaşmanın ne kadar süreceği merak konusudur.