Mystery Inc. iki yıl önce dağılmıştır, ancak Scooby Doo ve arkadaşları Fred, Daphne, Shaggy ve Velma, Spooky Adası'na çağrılır. Adanın sahibi Emile Mondavarious, adanın perili olduğuna inanır ve bu yüzden ekibi bir araya getirir. Spring Break sırasında meydana gelen tuhaf olayları araştırmaları gerekmektedir. Scooby ve ekibi, kişisel farklılıklarını bir kenara bırakıp birlikte çalışmak zorundadır. Adada gizemli olaylar yaşanır, ekip bu olayların peşine düşer.