Zootropolis şehri bu kez daha karanlık ve karmaşık bir olayın içine sürüklenir. Cesur tavşan polis Judy Hopps ve kurnaz tilki Nick Wilde, görünüşte sıradan bir kaybolma vakasının ardında çok daha büyük bir komplo olduğunu fark eder. İzler onları şehrin farklı bölgelerine, gizemli yeraltı ağlarına ve tehlikeli karşılaşmalara götürür. Adım adım ilerleyen soruşturma sırasında ikili hem dostluklarını sınar hem de kendi içsel korkularıyla yüzleşir. Zootropolis’in geleceğini etkileyecek bu davada verdikleri kararlar yalnızca adaleti değil, tüm şehrin kaderini belirleyecektir.