Rogue Warfare: The Hunt, Daniel liderliğindeki ABD askerlerinden oluşan elit bir ekibin, küresel güvenliği tehdit eden bir terörist grubun peşine düşmesiyle başlıyor. Ekip, biyolojik ve teknolojik tehditler kullanan bu grubu durdurmak için harekete geçiyor. Ancak işler karmaşık bir hal alıyor, çünkü teröristler Daniel'i kaçırıyor. Ekip, liderlerini kurtarmak için zorlu arazilerde mücadele ederken, teröristlerin izini sürmeye devam ediyor.