2048 yılında beklenmedik canavarlar dünyayı istila ediyor ve bu durum, gezegeni insanlar için yaşanmaz hale getiriyor. İnsanlıyor, uzay gemileriyle başka bir gezegene göç etmek zorunda kalıyorlar ancak yeni keşfettikleri gezegendeki yaşam koşulları da hayatta kalmalarını imkânsız hale getiriyor. Bu zorlu koşullar altında, aralarından biri canavarlarla savaşmayı ve dünyayı yeniden insanlarla doldurmayı hedefliyor. Godzilla: Monster Planet, bu mücadeleyi ve insanların hayatta kalma çabalarını konu alıyor.