Monsters University, Mike Wazowski'nin çocukluk hayali olan korkutma uzmanı olma yolculuğuyla başlıyor. Mike, Monsters University'ye kabul ediliyor ve burada James P. Sullivan, yani Sully ile tanışıyor. İkili, başlangıçta birbirleriyle pek iyi anlaşamıyor ve sürekli rekabet ediyorlar. Ancak, bir olay sonucu ikisi de korkutma programından atılma tehlikesiyle karşı karşıya kalıyor.

Mike ve Sully, kendilerini kanıtlamak için Oozma Kappa adlı bir öğrenci kulübüne katılıyorlar. Bu kulüp, üniversitenin en zayıf kulübü olarak biliniyor. İkili, kulübün diğer üyeleriyle birlikte korkutma yarışmalarına katılmaya karar veriyor. Yarışmalar boyunca, Mike ve Sully'nin dostluğu gelişiyor ve birbirlerinin güçlü yönlerini keşfetmeye başlıyorlar. Sonunda, takım çalışması ve dostluk sayesinde yarışmayı kazanıyorlar ve korkutma programına geri dönüyorlar.