Stuart, küçük bir fare, Little ailesi tarafından evlat edinilir. Aileye katıldıktan sonra, evin kedisi Snowbell ile tanışır. Snowbell, Stuart'ı pek sevmez, bu da aralarında bir rekabet başlatır. Stuart, yeni ailesine uyum sağlamaya çalışırken, Snowbell'in planlarıyla uğraşmak zorunda kalıyor.

Stuart, evdeki diğer hayvanlarla da tanışır, bu sırada Snowbell'in düşmanlığı devam ediyor. Bir gün, Stuart'ın gerçek ailesi olduğunu iddia eden iki fare ortaya çıkar. Bu durum, Stuart'ın hayatını altüst ediyor, çünkü kim olduğunu sorgulamaya başlıyor.

Stuart, gerçek ailesiyle ilgili gerçeği öğrenmeye çalışırken, Snowbell'in de yardımıyla bazı zorlukların üstesinden gelir. Ancak, işler her zaman planlandığı gibi gitmez. Stuart, Little ailesinin yanında kalmaya karar verir, çünkü orada kendini gerçekten ait hissediyor.