Ethan Hunt, Solomon Lane'i yakaladıktan iki yıl sonra, Apostles adında yeni bir terörist organizasyon ortaya çıkıyor. Bu grup, John Lark adlı gizemli bir lider tarafından yönetiliyor ve üç plütonyum çekirdeğini ele geçirmeyi planlıyor. Ethan ve ekibi, bu tehlikeli durumu önlemek için Berlin'e gidiyor ancak işler planlandığı gibi gitmez. Ethan, Luther'ı ve Apostles'ı istemeden kurtarıyor ve bu durum, çekirdeklerin kaybolmasına yol açıyor. Şimdi, Ethan ve ekibi, çekirdekleri geri almak için zamana karşı yarışıyor.