Berlin'de gizli görevde bulunan Kuzey Koreli bir ajan, beklenmedik bir ihanetle karşılaşıyor ve bu durum onu tehlikeli bir kaçışa sürüklüyor. Kuzey Kore elçiliğinde tercüman olarak çalışan eşini de yanına alarak, peşlerine düşen Kuzey ve Güney Koreli ajanlardan kaçmak için her türlü çabayı gösteriyorlar. Berlin Dosyası'nda, çiftin bu zorlu kaçış sürecinde yaşadıkları gerilim dolu anlar ve karşılaştıkları engeller, hikayenin merkezinde yer alıyor. İhanetin gölgesinde, hayatta kalma mücadelesi veriyorlar ve bu süreçte birbirlerine olan güvenlerini sınamak zorunda kalıyorlar.