Justice League: Gods and Monsters, alternatif bir evrende geçen bir hikaye sunuyor. Filmde, Batman, Wonder Woman ve Superman'den oluşan Justice League, dünyada düzeni sağlamak için bağımsız ve acımasız bir güç olarak hareket ediyor. Bilim insanları Victor Fries, Ray Palmer ve Silas Stone, küçük oğlu Victor ile birlikte, Justice League benzeri bir şekilde öldürülüyor. Başkan Amanda Waller, bu bilim insanlarından hükümetin yürüttüğü soruşturmada işbirliği yapmalarını talep ediyor. Bu esnada Superman, Lois Lane'i Adalet Kulesi'ne davet ediyor ve burada insanlığa yardım etme hedeflerini açıklıyor.

Magnus ve eşi Tina, Lex Luthor tarafından görevlendirilen bilim insanlarının dahil olduğu Project Fair Play hakkında sorgulanıyor. Magnus, diğerlerinin ne bildiğini sormayı öneriyor ve cevaplar için bilim insanlarını bir araya topluyor. Ancak, Boom'un tüpünde seyahat eden üç robot suikastçı tarafından saldırıya uğruyorlar. Suikastçılar, ellerinden gelenin en iyisini yapmalarına rağmen, saldırıdan kurtulan tek kişi olarak Magnus'u bırakıyor. Luthor, projenin sonunda federasyonu yok etmenin bir yolunu bulduğunu ortaya koyuyor ve ayrıca Zod hakkında Superman'e bazı gerçekleri açıklıyor.

Superman ayrılırken, Superman'in güçlerine sahip olan Katil Robot patlıyor, uyduyu yok ediyor ve görünüşte Luthor'u öldürüyor. Steve Trevor, Waller'a patlamanın ve Superman'in varlığının uydu görüntülerini gösteriyor. Kripton'un güneşine benzer kırmızı güneş radyasyonu ile donatılmış askerler ve araçlardan oluşan Fair Play Projesi, intikam almak için harekete geçiyor. Superman ve Wonder Woman orduyla yüzleşirken, Batman, Magnus'un güç alanını etkinleştirdiği Kule'de kalıyor.

Tina aniden ortaya çıkıyor ve Platinum adındaki sıvı metal bir robota dönüşmeden önce Batman'i yeniyor, ardından Magnus'u güç ve iyileşme sağlayan organik bir Nanite serumuyla canlandırıyor. Magnus, her şeyi Metal Adamları kullanarak düzenlediğini açıklıyor.