30 yıl önce uzaylılar dünyayla ilk temaslarını kuruyor ve insanlar bu durumu ya bir saldırı ya da büyük bir teknolojik devrimle sonuçlanmasını bekliyor. Ancak uzaylılar, kendi gezegenlerinde hayatta kalan son bireyler olarak sığınmak için dünyamıza geliyorlar. Tüm dünya hükümetleri, bu yaratıklarla nasıl bir yol izleyeceklerini tartışırken, uzaylılar Güney Afrika'da District 9 olarak bilinen bir alana geçici olarak yerleştiriliyor. Uzaylıların dünyada varlığına dair sabır artık tükenmek üzeredir ve uzaylılar üzerindeki kontrol, Multi-National United MNU adlı özel bir şirkete devrediliyor. Bu şirket, uzaylıların silahlarını üretebilirlerse büyük kazançlar elde etme peşindedir ancak MNU bu konuda başarısız kalıyor çünkü silahların çalışması için gerekli olan şey uzaylı DNA'sıdır.

Bir MNU çalışanı olan Wikus van der Merwe, gizemli bir virüs kaparak DNA'sında değişiklikler yaşamaya başlıyor. Bu durum, insanlar ve uzaylılar arasındaki gerilimi zirveye taşırken, Wikus, en çok aranan ve en değerli kişi haline geliyor çünkü o, uzaylıların teknolojisini çözmenin anahtarıdır. Şimdi, Wikus'un kendini koruyabileceği tek yer, düşmanca bir ortamda District 9 oluyor.