1943 yılında Amerikan donanması, Philadelphia limanında USS Eldridge adlı bir korvet üzerinde deney yapıyor. İddialara göre, gemi birkaç dakika içinde 600 kilometreden fazla bir mesafeye gidip geri döner. Bu deneyin ardından, gemi bir havaalanında aniden belirir. Olayın ardından, ilk denemeden sağ kurtulan tek kişi olan Lea ve torunu Ullerup, bu felaketi önlemek için harekete geçer.

21. yüzyılda, nesneleri görünmez hale getirmeye çalışan bir araştırma grubu, kullandıkları teknolojinin Philadelphia Deneyi ile bağlantılı olduğunu fark etmez. Bu durum büyük bir sürpriz yaratır. Araştırma grubunun deneyimleri, geçmişteki olaylarla beklenmedik bir şekilde kesişir. Olaylar hızla gelişir ve karmaşık bir hal alıyor.