Bir hükümet ajanı, ölümcül bir hastalığa yakalandığını öğreniyor ve işini bırakıp karısı ve çocuğuyla daha fazla zaman geçirmeye karar veriyor. Ancak ona son bir görev teklif ediliyor ve bu görevi kabul ederse hastalığını durduracak bir bilimsel ilaç alacağı söyleniyor. Son Üç Gün'de ajan, ailesiyle geçireceği zamanı ve hayatını kurtarma fırsatını dengelemeye çalışırken, tehlikeli bir dünyada hayatta kalma mücadelesi veriyor. Görevi kabul etmesiyle birlikte, hem ailesiyle olan ilişkilerini hem de kendi hayatını yeniden gözden geçiriyor.