Japonya, devasa boyutlardaki S-Sınıfı Türler olarak bilinen yaşam formlarının tehdidi altındayken, hükümet bu tehlikeye karşı SSSP adında bir protokol geliştiriyor. Ülkenin önde gelen isimlerinden oluşan bir ekip, bu devleri kontrol altına almak için yoğun çaba sarf ediyor. Ancak, bu süreçte uzaydan gelen gümüş bir dev olan Ultraman ortaya çıkıyor ve olaylar beklenmedik bir hal alıyor.