Bir film yapımcısı, okyanusların derinliklerindeki yaşamı keşfetmeye karar verir. Başlangıçta deniz canlılarının güzelliğini ve çeşitliliğini kaydetmek ister. Ancak araştırmaları ilerledikçe, insanların denizlere verdiği zararların boyutlarıyla karşılaşır. Çevresel, ekonomik ve politik karmaşıklıklar. Küresel bir yolsuzluk ağına ulaşır, deniz kaynaklarının kontrolü için kurulmuş bir ağ.

Yapımcı, belgeler ve tanık ifadeleriyle bu ağı deşifre eder. Deniz ekosisteminin çöküşü gözler önüne serilir. Okyanusların Sessiz Çığlığı, deniz canlılarıyla ilgili görüntülerle yolsuzluk skandallarını iç içe geçirir. Gerçekler kamuoyuna ulaşır, ama bu süreçte birçok engelle karşılaşır. Tehditlerle mücadele eder, vazgeçmez.