Justine ve Michael evlenir, kutlama Claire'in malikânesinde yapılır. İki kız kardeş, Justine ve Claire, farklı karakterlere sahiptir. Justine melankolik, Claire ise daha dengelidir. Düğün günü, aile içindeki sorunlar ortaya çıkar. Bu sırada Melancholia adlı gezegen dünyaya yaklaşır.

Justine'in içsel karmaşası, dışarıdaki felaketle birleşir. Herkes kendi sorunlarıyla uğraşırken, gezegenin tehdidi büyür. Claire, durumu kontrol etmeye çalışır. Justine ise kendi dünyasında kaybolur. Melancholia'nın yaklaşımı, her şeyi değiştirir.