1967 yılında Pekin'den genç bir öğrenci olan Chen, Moğolistan'da bir grup çobanın yanına giderek onlara eğitim vermek üzere görevlendiriliyor ve bu deneyim onun için önemli bir dönüm noktası oluyor. Chen, doğanın kucaklayıcı ortamında, çobanlarla birlikte vahşi kurtlarla insanlar arasında gelişen ilişkiyi gözlemliyor. Ancak bu huzurlu yaşam, bölgeye bir hükümet yetkilisinin gelmesiyle altüst oluyor. Yetkili, bölgedeki vahşi kurtları ortadan kaldırma planları yapıyor ve bu durum, Chen ve çobanlar için bölgenin dengesini bozacak bir tehdit oluşturuyor. Wolf Totem, bu olaylar zincirini ve doğayla kurulan barışçıl ilişkinin tehlikeye girmesini anlatıyor.