12 Eylül darbesinin sert atmosferinde geçen Kafes, gençlerin cezaevindeki zorlu yaşamını anlatıyor. Filmde İsmail Hacıoğlu canlandırdığı karakterle işkenceler ve baskılar arasında hayatta kalmaya çalışıyor. Nilay Duru ve Fırat Şahin'in canlandırdığı karakterler de bu karanlık dönemde yaşadıkları çaresizlikle mücadele ediyorlar. Cezaevindeki günler birbirini kovalarken, dışarıdaki siyasi karmaşa içerideki hayatları daha da zorlaştırıyor. İşkence sahneleri, gençlerin direnişi ve umutsuzluk arasında gidip geliyor. Kafes, bu karanlık dönemde yaşanan insanlık dramını gözler önüne seriyor. Her şeyin ne zaman değişeceği belirsizken karakterler kendi yollarını bulmaya çalışıyor.