Seal Team, Benji adında bir fokun köpek balıkları tarafından avlanmasını konu alıyor. Benji'nin en yakın arkadaşı Quinn, köpek balıklarının saldırılarına karşı bir ekip kurmaya karar veriyor. Quinn, askeri deneyime sahip Claggart'ın da ekibe katılmasıyla köpek balıklarına karşı daha güçlü bir savunma oluşturmayı hedefliyor. Claggart'ın yardımıyla Quinn ve ekibi, köpek balıklarını püskürtmek için akıllıca bir plan geliştiriyor.

Köpek balıkları Sea Island'a geri dönerek fokların yaşamını tehdit etmeye başladığında, Quinn ve ekibi yeni bir savunma sistemi kurmaya karar veriyor. Claggart'ın eski gemisine köpek balıkları geldiğinde onları uyaran bir sistem kurarak, köpek balıklarının kurnaz zekâsına karşı hazırlıklı olmaya çalışıyorlar. Quinn, arkadaşları ve Claggart, köpek balıklarını savuşturmak için yaratıcı stratejiler geliştiriyor ve Sea Island'ı korumak için ellerinden geleni yapıyorlar.