Altı yaşındaki Hushpuppy, Louisiana'nın bataklıklarında babasıyla birlikte yaşamaktadır. Babası, gizemli bir hastalığa yakalanınca Hushpuppy'nin dünyası sarsılır. Bu sırada doğa da dengesini kaybediyor, yer kabuğundan dinozorlar çağından kalma yaratıklar uyanmaya başlıyor. Hushpuppy, bu kaosun ortasında hayatta kalmaya çalışıyor, babasının öğretileriyle başa çıkmaya çalışıyor.

Bataklıkların derinliklerinde, Hushpuppy'nin karşılaştığı zorluklar artıyor. Babasının hastalığı ilerlerken, çevresindeki dünya da değişir. Dinozorlar çağından kalma yaratıklar, yer kabuğundan çıkar ve Hushpuppy'nin cesareti sınanır. Bu yeni dünyada, Hushpuppy'nin hayatta kalma mücadelesi devam ederken, doğanın dengesizliği de giderek artıyor.