Denizin derinliklerinde başlayan tuhaf olaylar, radyoaktif dev kalamarın ortaya çıkmasıyla iyice karışır. Atom bombası testlerinin ardından mutasyona uğramış bu yaratık, yüzeye çıkarak avlanmaya başlar. Komutan Pete Mathews'in komutasındaki atom denizaltısı, kalamarın saldırısına uğrar ama şans eseri kaçmayı başarır. Bilim insanları Prof. Lesley Joyce ve Dr. John Carter, yaratığın devasa bir kalamar olduğunu ortaya koyar. Donanma başlangıçta bu iddiaya inanmaz, ancak saldırılar artınca gerçekler saklanamaz hale gelir.

Kalamar, San Francisco'ya kadar ilerleyip Golden Gate Köprüsü'nü yıkar ve karada büyük zararlar verir. Durum ciddileşirken, özel olarak geliştirilmiş bir torpido dev kalamarı durdurmak için kullanılır. Bu zorlu mücadele sonunda yaratık etkisiz hale getirilir ve tehlike sona erer. Film, okyanusun derinliklerinden gelen bu büyük tehdidin nasıl alt edildiğini anlatır.