Dört çocuğa sahip bir kadın, eşinin vefatının ardından çocuklarını anneannesinin yanına bırakmaya karar veriyor. Kadının babası, büyük bir mal varlığına sahip ve bu varlıktan yararlanabilmesi için tek bir şart öne sürüyor. Çatıdaki Çiçekler filminde, çocuklar anneannelerinin evinde gizli bir yaşam sürmeye başlıyor. Ancak zamanla bu evdeki sırları ve kendi içlerindeki dayanışmayı keşfediyorlar. Çocuklar, bu zorlu süreçte birbirlerine daha da yakınlaşıyor ve hayatta kalma mücadelesi veriyorlar.