Agnes, manastırda diğer rahibelerle birlikte sıradan bir yaşam sürerken, bir gün kötü niyetli bir iblis tarafından ele geçiriliyor. Bilincini kaybeden Agnes, saldırgan ve agresif bir tutum sergilemeye başlıyor. Baş Rahibe, bu durumu fark edince, şeytan çıkarma ayinleri konusunda tanınmış bir isim olan Peder Donaghue'yi çağırıyor ve yanında öğrencisi Benjamin'i de getiriyor. Baş Rahibe, Benjamin'in varlığından hoşlanmasa da, Agnes'in iyileşmesi için manastıra girmesine izin vermek zorunda kalıyor.

Peder Donaghue'nin çabaları sonuç vermeyince, başka bir pederin çağrılması gerektiği düşünülüyor ve bu sefer Peder Black devreye giriyor. Peder Black, Agnes'in içindeki şeytanı çıkarmak için gizli bir ayin düzenliyor. Bu süreçte, kiliseler resmi olarak kabul etmese de şeytan çıkarma ayinleri gizli bir şekilde gerçekleştiriliyor. Agnes'in içindeki şeytanın çıkarılması için yapılan bu ayinler, manastırda gerilimi artırıyor ve olaylar giderek daha karmaşık bir hal alıyor.