Beethoven, Missy adında Bernard cinsi bir köpekle tanışır. Missy'nin sahibi, bu dostluğa karşı çıkar. Beethoven, Missy ile vakit geçirmek için her yolu dener. Sahiplerinin engellerine rağmen, aralarındaki bağ güçlenir. Sonunda, Missy'nin sahibi bile onların bir arada olmasına razı olur.